第二百三十六章 公司ai的普及应用 (第2/2页)
崔敏进门之后。
“您好，我叫李扬，是公司这边数据科学家，公司这边近期开发了一种新的生成模型，可以帮助到你的科研项目。”李扬却是开门见山，没有半点客套。
崔敏倒是比较喜欢这种沟通方式，因为足够的节省时间。
“你好，我是崔敏，公司的高级化学家，怎么帮？”
崔敏对李扬说的话却是持怀疑态度。生成模型她当然知道，不过可靠性还有准确性却是很让人怀疑。而且从心底里，她也不认为一个生成模型就能够取代人类的专业知识和直觉。
不过本着这段时间在爱英生物科研的良好体验，她也没有拒绝。
之后李扬跟着崔敏来到她的实验室，在那里李扬将他的笔记本电脑连接到她的工作站上。
他打开了一个应用程序，显示了一个看上去非常简单的操作界面，并有几个选项和参数。
“在开始之前，我们需要确定一下目标从属性。”李扬说道。“比如说，你想要找到什么属性的分子，当然这块儿说起来比较复杂，有没有关于你的候选物质的结合亲和力的数据？”
“有。”崔敏说着，示意了一眼不远处的她的助理，她的助理快速地在电脑上操作起来，片刻功夫之后，就呈现了一组数据。
“好的，接下来我把它们上传到这个模型里。”李扬说着，拿出手机，直接拍下了相关数据，一页，两页，三页.拍摄的同时，相关的数据信息片刻功夫之后，就已陆续呈现在了电脑屏幕上。
“你们可以对一下，看看数据有没有错漏，没有的话，我就让他运行了。”李扬说道。
崔敏点点头，稍作检查之后。
“没问题。”
李扬轻点之后，这个界面初步运行起来，进入下一页。
“好了，现在我们可以设置我们想要生成的 IC50值范围。”李扬说道。他在屏幕上移动了两个滑块，直到它们显示为 0-10 nM。
崔敏微微有些惊讶李扬的操作，但也没说什么。
“这个小的数值？”崔敏助理却是直接惊讶道，一般ic50的数值越小，说明抗体的特异性能越强，效果越好。“我们现在还没有一个候选物质有这么低的 IC50值。”
“待会儿就知道了。”李扬笑着说，表现的却是非常有自信。“它可以探索你没有探索过的化学空间区域。”
他点击了另一个选项，允许他为生成分子指定一些额外约束条件。
“我们还要确保我们的分子是类药物化合物。”毕竟是爱英集团高薪挖来的数据师，在这里工作这么长时间了，一些普通的专业知识，他已经理解了不少。所以往往还未等崔敏说什么，李扬就已经打开了对应页面。
“这意味着它们应该具有合理的分子量、logP值、溶解度等等。我们可以使用一些常见过滤器，如 Lipinski的五规则或 QED分数来筛选掉不理想的化合物。”
他在屏幕上勾选了一些框，并相应地调整了一些阈值。
“还有别的吗？”他问崔敏。
“嗯，需要避免那些与我已经拥有的分子太相似的分子。”崔敏说道。“不用浪费时间和资源在测试重复或近似重复的化合物。”
李扬点点头，而后在 Tanimoto相似性系数的截止值处输入了 0.8，这是一种常用的比较分子结构的指标。
“那就开始了？”李扬转头又问。
崔敏轻轻嗯了一声。
随后点击了一个标有“生成”的按钮。模型开始工作，在屏幕上显示一个进度条和一些统计数据。Alice紧张地观看，想知道是否会有任何有用的东西出现。
大约 3分钟后，模型完成了 1000个满足所有条件的分子的生成。它根据它们预测的 IC50值对它们进行排序，从最低到最高，并以表格格式显示它们为 3D结构。它还突出显示了它们的关键特征，如功能团、环或杂原子。
这一刻的崔敏再没了之前的从容，一脸不敢置信。
她走到电脑前，快速地滚动界面，仔细地看着每个分子。而越看，惊讶也就越大，这些分子确实是多样化和创新性的，显示出不同于她候选物质的骨架、取代基和连接方式。其中一些看起来很熟悉，类似于已知药物或天然产物；另一些则完全陌生，展示了一些她从未见过的结构。她选中了一个分子，它有一个复杂的环状结构，上面有一些氧和氮原子。
崔敏头也不回地对李扬问道，“这个分子能合成吗，有合成路径嘛？”
“当然。”李扬点点头。“我们的模型不仅可以生成分子结构，还可以生成合成路线。你只需要点击这个按钮，就可以看到详细的步骤和反应条件。”
说着李扬移动鼠标，在一个位置上稍稍停顿示意给崔敏看了之后，才轻轻点击了一下，屏幕瞬间跳转到了一个新窗口，显示了该分子的合成路线。它包括四个步骤，每个步骤都给出了所需的试剂、溶剂、温度和时间。
“我从没想过能用这种方式设计和合成新药。”崔敏脸上的震惊依旧，但已是抑制不住的笑意。
这个对她来说，实在是太有用，太好用了。
“崔老师，我是不是要失业了？”一旁的崔敏助理却是苦着脸，因为刚才的这些工作，就是他平日里做的工作，但可以肯定的是，他几个月的工作量也比不上这个系统几分钟的结果。
这一刻，他感觉自己之前的工作，完全失去了意义。
“暂时不会，你可以做些其他的，”崔敏头也不回的说道，此刻她在不断的点击一个又一个的化合物的合成路径。
眼神间尽是惊喜。
(本章完)